广州中医药大学第一附属医院位于广州市白云区三元里地区，北临广园路，东接中医药大学，西接机场路，南靠中医药大学。院区内地势较平坦，南高（12.4m）北低（10.7m）。院区内分为医疗服务区、后勤区和居住区三大块。院区设有三个出入口，主要出入口设在用地西侧靠南，由一个约1000m2 的绿化广场组成；次要出入口设在北面，主要为后勤与污物出入口；另一个次要出入口设在东边靠南，与中医药大学校区连接。

广州中医药大学第一附属医院按照“标准实用、环境优美、分区合理”进行总体设计和分期改、扩建。医疗服务区、后勤区与居住区自西向东呈长条形排列，分区既鲜明又联系密切。医疗服务区有建筑4栋（门诊综合楼、医技楼、住院楼、临床教学楼），医技楼建于1974年，改造装修后使用，住院楼、门诊综合楼、临床教学楼、分别于1998年、2005年、2012年开始建设，除临床教学楼正在施工外，其余均投入使用。

后勤服务区现有建筑4栋（供应楼、后勤楼、进修楼、电工房），居住区现有建筑7栋（6栋职工宿舍和1栋学生宿舍）。为解决院区的停车问题，在门诊综合楼北边扩建了一个三层地下室，满足停车要求。地下室顶上修建一个大型绿化园林区域，增加院区的绿化面积，也为病人提供一个优美舒适的休息空间。

整个医院门诊面积为29892㎡，日门诊量9000 人次，住院面积为81416㎡，共1803 床。手术室共22 间，ICU 约2500㎡。